Haruto Kirišima žil klidný život na venkově, daleko od rychlého života ve městě. Pak se v jeho životě zničehonic objevila Yuzuki Eba, která přijela z Tokia, aby krátce žila se svou rodinou. Jejich společné chvíle v něm zanechaly vzpomínky na toto krátké období, než stejně náhle zmizela z jeho života a zanechala v něm plno otázek... Kimi no Iru Machi začíná o nějaký čas později, poté, co se Haruto přestěhoval do Tokia ke své sestře, aby se mohl věnovat kariéře kuchaře. Ve skutečnosti si však přeje být s Yuzuki. Věci však nezačínají dobře. Po příjezdu si ho spletou se zlodějem a napadne ho sestřina sousedka Mišima Asuka. Poté, co se nedorozumění vysvětlí, začnou jeho city kolísat. Je pro něj Eba, která se mu zdánlivě bezdůvodně vyhýbá, ta pravá, nebo je to Asuka?