몸 안에 잠들어있는 시노비의 힘을 보다 강력하게 끌어내 주는 '닌자껌' 이에 대한 연구 개발을 극비로 진행하던 'WNA'의 연구원인 버튼, 베레카, 론 3명은 실패 기록을 경신할 뿐이었다. 실험을 시작한지 3년이 흐르고, 드디어 '닌자 껌' 개발에 성공! 가장 강한 시노비의 힘을 가진 닌자를 찾기 위해 닌자 껌을 사용한 익스트림 닌자 경기 대회 'Ninjala'가 개최되지만, 그 뒤에서는 닌자 껌을 둘러싼 사건과 음모, 미지의 생명체가 교착한다…….