Kilenc éve, hogy eltűnt a Jupiter holdjai között keringő rejtélyes kőhasáb felkutatására indult űrhajó legénysége. Közös orosz-amerikai expedíció indul útnak, hogy kiderítse, mi történt 2001-ben, és megfejtse a különös fekete monolit titkát. Miközben az egymást gyanakodva méregető űrhajósok kezdenek összeszokni, az őket delegáló nagyhatalmak között elmérgesedik a viszony. A diplomáciai kapcsolatotok megszakítása után az űrhajósokat a közös kutatás felfüggesztésére és az azonnali visszatérésre utasítják. Ám különös dolog történik, a monolit ismét hatni kezd.