A jövőben az emberiség extrém méretű környezetszennyezésének (és atomtevékenységének) köszönhetően a mutánsok köztünk élnek. Főhősünk is egy ilyen mutáns, és az EDF katonája. A szervezet célja az emberiség védelme a szörnyektől és főleg Godzillától, akit pár éve sikeresen csapdába ejtettek a déli sarkon. Viszont amikor az emberhúsra éhes idegenlények irányításuk alá vonják az összes szörnyet és majdnem leigázzák a földet, az emberiségnek egyetlen reménye marad a túlélésre: Ki kell szabadítaniuk Godzillát.