Die Dezalg sind zurück mit einer neuen Waffe und drauf und dran diese an den Verteidigungsanlagen von Megazone 23 zu erproben. Daran glaubend dass die Lösung dafür ebenfalls neue Waffen wären, versucht sich B.D. erneut an EVEs letzter Verteidigungsstufe. Denn volle Kontrolle über Megazone 23 würde ungehinderte Waffenentwicklung bedeuten. Shogo, der mittlerweile zu seinem normalen Leben zurückgekehrt ist, wird erneut von EVE zur Hilfe aufgefordert. Der bevorstehende letzte Kampf zwischen allen beteiligten Parteien führt zu Entdeckung von Eves letztem Geheimnis A.D.A.M, welches katastrophale Auswirkungen für alle bedeuten könnte.