虚幻勇士这部动画讲述的是凯德学院的5位学生：Aelita、Jeremy、Odd、Ulrich、Yumi与邪恶的人工智能程序XANA对抗的故事。Jeremy在离凯德学院不远的一座废弃工厂里发现了一台神秘的超级计算机，并且在好奇心的驱使下开启了它，之后发现了这台计算机运行着一个被称为兰科（Lyoko）的虚拟世界，并在虚拟世界内发现了一位神秘女孩。Jeremy给她起了一个名字叫Maya，后来Maya从圆塔中得知自己叫Aelita，就在超级计算机被开启后，凯德学院发生了各种奇怪事件，如要使这些奇怪事件不再发生就必须关闭超级计算机，但是这样做的话Aelita也会消失，Jeremy不希望这样，他要想办法让Aelita脱离超级计算机，在Jeremy想办法的这段时间里，XANA不断的向地球发动进攻，各种威胁人类生命的事情发生了，就在这时，Jeremy结识了同班同学Odd、Ulrich以及Ulrich在体育馆认识的Yumi，他们共同抵抗着XANA的进攻，为了阻止XANA对地球的威胁，Aelita必须进入由夏之纳启动的圆塔中，并把它锁定，只有这样才能阻止XANA的攻击。在兰科中XANA制造了许多怪兽（攻击性程序）阻止Aelita进入圆塔，Odd，Ulrich，Yumi则要通过扫描仪虚拟化后进入兰科帮助Aelita消灭怪兽。Jeremy则在现实世界操作计算机并给在兰科的他们提供战术信息，在成功锁定圆塔后，Jeremy会启动时间倒转程序让时间回到夏之纳发动攻击之前的状态，但前提是在夏之纳发动攻击时没有人类伤亡，时间倒转程序并不能让死去的人复活。在虚拟世界兰科中Odd，Ulrich，Yumi分别拥有100点生命点数，一旦生命点数归零，扫描器程序会自动把他们实体化并送回现实世界，但在第一、二季中Aelita的生命点数一旦归零则会被删除而不复存在，从第三季开始Aelita可以自由进出兰科，生命点数归零后也会和其他人一样被实体化主要人物。