“未知”是很久以前突然出现的一个神秘的敌人。作为应对措施，“进化铁路发展局”（ERDA）开发了“Shinkalion”机器人，可以变身为子弹头列车，为应对威胁做好准备。 “我想成为一个能保护某些东西的酷人……”初中二年级的学生大城泰成（Taisei Oonari）为了寻找两年前失踪的姐姐的线索，转学到新开学园中学。 就在那时，“未知”出现了10年来的第一次。泰曦作为一名新卡里昂飞行员，碰巧有很高的天赋值，被迫决定与之对抗。未知的真实本质是什么，它的目的是什么？战斗结束后，真相是什么？男孩们决心和成长的故事现在开始了。