横滨市未来区的港区，一直延续著历代光之美少女在此地联手，打败谜之敌人“融合”的佳话。憧憬著光之美少女的市民们，无一不为这个话题而兴奋；但对刚刚转校、没有朋友的坂上步来说，她无法融入大家一起分享这份喜悦。就在这时，步在学校附近遇上了神秘生物“小呼”，两人很快变得十分要好。然而，小呼其实是“融合”的黑暗碎片，为了孤独的步，它决定吸收步一切美丽的事物，进而毁灭城镇！为了传递步真正的想法，28位光之美少女再次集结大家的力量，闪耀奇迹之光！