В одном из мегаполисов Японии, где жизнь течёт стремительно и благополучно, произошло необъяснимое: пропало всё население города. Это событие ставит правительство страны на уши.
Парень Такуя — одинокий курьер, работающий по контракту на исследовательскую организацию. Однажды он встречает девушку Юки, которая является единственной выжившей после того инцидента. Она считает, что происшествие как-то связанно с посланием её отца, который тоже бесследно пропал. Парочка решает отправиться в тот город-призрак и разузнать тайну пропажи горожан.
Однако не всё так просто. На пути расследования им повстречаются не только препятствия в виде заговоров секретных организаций, но и столкновение с призраками давно ушедших из жизни людей, которые всё ещё обитают в этом месте.