Kaijuu są wielkimi potworami, które od lat spędzają mieszkańcom Japonii sen z powiek. Kafka Hibino już za dzieciaka marzył, aby wstąpić do Korpusu — jednostki walczącej z kaijuu, jednak rzeczywistość daleko odbiega od tego, co chciał osiągnąć. Jako sprzątacz, który żadnej szczególnej integracji ani z członkami Korpusu, ani tym bardziej z kaijuu, nie ma, Hibino dochodzi do wniosku, że jego marzenie było tylko naiwną myślą dziecka. Niespodziewanie jednak natrafia na tajemniczego pasożyta, który atakuje go i dostaje się do jego ciała — tym sposobem chłopak nie tylko staje się jednym z przerażających monstrum, przed którymi chciał chronić innych; dzięki nabytym mocom jego marzenie o wstąpieniu do Korpusu może naprawdę się ziścić.