Wanneer een natuurramp de heilige Boom der Zielen dreigt te vernietigen, besluiten Ralu en Entu, twee Omaticaya-jongens die op de rand van volwassenheid staan, onbevreesd het heft in eigen handen te nemen. Als ze horen dat Toruk hen kan helpen de Tree of Souls te redden, gaan ze samen met hun nieuwe vriend Tsyal op zoek naar hoog in de Floating Mountains om het machtige rood-oranje roofdier te vinden dat de hemel van Pandora regeert. De profetie gaat in vervulling wanneer een zuivere ziel tussen de clans opstaat om voor de eerste keer op Toruk te rijden en de Na'vi te redden van een verschrikkelijk lot.