Een spionne breekt in bij het Japanse veiligheidsbureau. Ze steelt documenten met de namen van spionnen die namens MI6, BND, CSIS, FBI en CIA werken voor de zogenaamde Black Organization. Yuya Kazami, een agent, betrapt haar op heterdaad waarop ze vlucht. Een dag later vinden Conan en zijn vrienden een vrouw die aan geheugenverlies lijdt. Ze blijven bij haar om te proberen haar geheugen weer terug te krijgen. Conan weet echter niet dat de vrouw in de gaten wordt gehouden.