De film geeft in het kort de geschiedenis van Hercules na het verslaan van Hades voor het goede, waarin hij trouwt met Meg en terug gaat naar zijn tienerjaren. Het toont in het bijzonder een adolescente Hercules vanaf zijn inschrijving en daarmee het begin van zijn avonturen op de Prometheus Academy, een school voor goden en stervelingen, die Hercules vermoedelijk woonde gedurende de tijd dat hij het trainen om een held te worden met zijn mentor, de satier Philoctetes.