Jonathan Kaplan (* 25. November 1947) ist ein US-amerikanischer Filmproduzent und Regisseur. Er ist der Sohn des Filmkomponisten Sol Kaplan und der Schauspielerin Frances Heflin, der Bruder der Schauspielerinnen Nora Heflin und Mady Kaplan sowie der Neffe des Schauspielers Van Heflin. Sein Film „Angeklagt“ (1988) brachte der Schauspielerin Jodie Foster ihren ersten Oscar als Beste Hauptdarstellerin ein und wurde bei den 39. Internationalen Filmfestspielen Berlin für den Goldenen Bären nominiert.