„Колонията” разказва историята на младо семейство (Уотсън и Брюл), което попада в Чили през 1973 година по времето на военния преврат. Тайната полиция на Пиночет отвлича съпруга, а любимата му успява да открие следите му в южната част на страната, в изолирана колония на име Дигнидад. Представяща се за благотворителна мисия, тази колония се управлява от свещеник (Майкъл Няквист), но всъщност е място, от което никой не е успял да избяга. Съпругата решава да се присъедини към култа, изповядван от местните заселници, за да открие начин да спаси мъжа си.