Egy év telt el azóta, mióta Okabe elérte a Steins;Gate világvonalat. Itt minden békés és nyugodt, Mayuri és Kurisu is életben van és élik mindennapjaikat. Mayuri mint labortag, Kurisu pedig a távoli Amerikában. Ez egy időgép és D-mail mentes világ, ahol főhőseink nyugodtan élhetnek. Azonban Okabe egyre furcsábban kezdi érezni magát és egyre gyakrabban vannak látomásai az előző világvonalak szörnyűségeiből. Eleinte nem foglalkozik vele, de miután Kurisu Japánba látogat egy konferencia miatt, ezek a látomások egyre csak erősödnek, olyannyira, hogy Okabe eltűnik ebből a világvonalból...