Blæksprutten dr. Octavius Brine nærer et indædt had til den langt mere nuttede pingvinrace. Forklædt som forsker vil Brine kidnappe alle pingviner i verden og forvandle dem til frastødende mutanter! Men de fire pingvinagenter Skipper, Kowalski, Rico og Rekrut er på sagen, og de får hjælp af indsatsstyrken Nordenvind, der består af en ulv, en sæl, en isbjørn og en ugle.